Die Betriebskosten setzen sich zusammen aus Stromkosten für die Wärmepumpe und Gaskosten für die Spitzenlast, CO₂-Abgabe auf Gas, die Wartungskosten für zwei Systeme und eventuelle Schornsteinfegerkosten.
Hybridanlagen haben häufig: geringere Stromkosten als reine Wärmepumpen, aber weiterhin fossile Brennstoffkosten, doppelte Wartungsstrukturen. Langfristig steigen die Kosten durch den CO₂-Preis tendenziell an.